Además de estos dos conjuntos de disposiciones que conciernen las especies y los espacios, el Protocolo SPAW implica también una serie de disposiciones transversales, entre las cuales :
- la instauración de estudios de impacto en el caso de proyectos y actividades que pueden tener un notable efecto en el medio ambiente ;
- la posibilidad de derogación a las obligaciones del Protocolo en el caso de actividades tradicionales ;
- el principio de inventarios de las áreas y de especies protegidas de conformidad con SPAW,
- el desarrollo de la investigación científica y técnica sobre estas áreas y especies, y el intercambio de información entre las Partes con respecto a sus programas de investigación o seguimiento así como, en la medida de lo posible, la coordinación de estos programas.
- Por último, el protocolo establece el principio de elaboración en concertación de medidas, criterios y directivas que corresponden a sus distintos objetivos.